楊堅(jiān)除了他的成就，還有很多的缺點(diǎn)，如喜怒無常，猜疑心重，容易受讒言所惑，時(shí)常命令左右窺視臣下，如有過失，則加重罪。這是文帝的短處，并且因而貽害子孫。

猜疑忠臣最典型的是高熲。楊堅(jiān)的妻子獨(dú)孤氏是北周重臣獨(dú)孤信的女兒，而高熲的父親則是獨(dú)孤信的屬下，還被賜姓獨(dú)孤。所以，楊堅(jiān)和高熲的關(guān)系也非同一般。而且后來在楊堅(jiān)建立隋朝時(shí)，高熲立下了汗馬功勞。楊堅(jiān)稱帝后，高熲被任命為尚書左仆射，為重臣之一。

楊堅(jiān)對(duì)高熲極為信任，甚至把他當(dāng)成自己的鏡子，說他可以糾正自己的過錯(cuò)。如果有人進(jìn)讒言誣陷高熲，楊堅(jiān)從來都不相信，反而把告狀的人治罪。高熲的官職已經(jīng)無法再往上封了，可見在楊堅(jiān)的心目中高熲的重要性。但在以后對(duì)于立太子的問題上，兩個(gè)人發(fā)生了矛盾。

當(dāng)時(shí)，楊堅(jiān)對(duì)楊勇已經(jīng)不滿，打算立善于偽裝，博得他和獨(dú)孤皇后信賴的楊廣為太子。但高熲并沒有覺察楊堅(jiān)的意思，極力反對(duì)廢立太子。楊堅(jiān)認(rèn)為是高熲在為私利和他作對(duì)，因?yàn)楦邿獾呐畠菏菞钣碌钠拮樱绻院髼钣录次唬歉邿庾鳛樵栏福涞匚恢呖上攵f不定會(huì)效仿自己，取代隋朝自立為帝。因?yàn)闂顖?jiān)是通過外戚這個(gè)身份奪取帝位的，所以對(duì)于高熲的位置的敏感性極強(qiáng)，但高熲卻沒猜到楊堅(jiān)的這些想法。

楊堅(jiān)后來借處理另一個(gè)大臣王世積時(shí)，將高熲牽連進(jìn)去，但只是免了官職，廢為平民，沒有置他于死地。

楊堅(jiān)在晚年的猜疑有時(shí)顯得很可笑。他為了禁止官員貪贓受賄，竟派人去向官員行賄試探，如果有人敢收下，就立即處死。

有次，一個(gè)武官的衣服和佩劍不太整齊，楊堅(jiān)就說是對(duì)他的不敬。他不是治武官的罪，而是說御史沒有盡到責(zé)任，因?yàn)橛肥菍ｉT監(jiān)督官員的。所以，楊堅(jiān)就處死了御史，諫議大夫站出來勸止楊堅(jiān)，竟也搭上了性命。

早期立法有功勞，晚年壞法有過錯(cuò)，這就是楊堅(jiān)的前后對(duì)照。楊堅(jiān)晚年還大量使用法外酷刑，即杖刑，在宮廷里就經(jīng)常放著棒子。后來，高熲勸說之后，楊堅(jiān)曾經(jīng)把杖棒廢除，但他打人時(shí)嫌鞭子抽打力量太小，于是，又恢復(fù)了杖刑。

在中國古代社會(huì)，行刑一般要在秋天，叫順應(yīng)天意，即秋天葉子要落，氣氛肅殺。而春天萬物復(fù)蘇，要生長了，這時(shí)嚴(yán)禁獵殺動(dòng)物，不許破壞幼小樹木。總起來說，就是春夏行賞，秋冬處罰。楊堅(jiān)在晚年時(shí)卻破壞了這種歷來的習(xí)慣，在夏天時(shí)就要?dú)⑷耍写蟪挤磳?duì)，他狡辯說，夏天時(shí)老天爺有雷電暴雨，這也是天意在發(fā)怒。

楊堅(jiān)的迷信程度很重，不但信佛教、道教，還信陰陽五行、鬼怪、符瑞、土地神、山神，還有龍王，他都信。在北周時(shí)候，武帝曾經(jīng)滅佛，楊堅(jiān)這時(shí)則予以恢復(fù)，下令百姓可以自愿出家。楊堅(jiān)在各地大建佛寺，正因如此，隋唐的佛教才興盛起來。

楊堅(jiān)文化程度不高，認(rèn)為文化沒用，學(xué)校也沒必要。到了公元601年，楊堅(jiān)便將郡縣的學(xué)校全部廢除，只留下了中央的國子監(jiān)，供官員貴族子弟們讀書。