董鄂妃深受順治寵愛，并很快懷孕了。順治十四年(1657)，她于承乾宮中產(chǎn)下一個男嬰，這是順治的皇四子。董鄂妃本來就受寵，此時又生了一個兒子，對于很多人來說，她就是一個威脅。而且，順治一直對皇后不滿，早就想廢皇后改立董鄂妃為后，只是苦于找不到理由。孝莊太后將一切看在眼里，她雖然也喜歡董鄂妃的賢淑，但是在政治和家族斗爭中，這點喜歡往往只能成為一聲嘆息。

董鄂妃臨產(chǎn)之時，孝莊太后就已經(jīng)想好了對策，她先搬到皇宮外的南苑(專供皇家冬天狩獵閱兵的地方)居住。董鄂妃生下皇子不久，孝莊太后便以自己身體不佳為由要董鄂妃前往伺候。一向恭順的董鄂妃雖然身體很虛弱，但還是前往南苑照顧孝莊太后，她的健康因此受到了很大的影響。

不久，董鄂妃受到了生命中最嚴重的打擊，她的孩子還未活到百日就夭折了。

經(jīng)此人生巨痛，董鄂妃一病不起，掙扎了三年后，一代佳人終于香銷玉殞，死時“言動不亂，端坐呼佛號，噓氣而死。薨后數(shù)日，顏貌安整，儼如平時”。

董鄂妃死后，順治十分難過，為了補償身前不能立她為后的遺憾，在她死后兩天就追封其為“孝獻莊和至德宣仁溫惠端敬皇后”，還親自撰寫了《端敬皇后行狀》來悼念她，關(guān)于她的好，他是“筆不勝書”，“傷悼中不能盡憶”。

董鄂妃的喪禮辦得非常隆重，順治甚至要求上至親王下到四品官，所有公主和命婦都要哭喪，“不哀者議處”，最終還是孝莊太后“力解乃已”。當(dāng)時已經(jīng)沒有殉葬的習(xí)俗，但是順治怕董鄂妃沒人陪伴服侍，甚至想將三十幾名宮女、太這位清朝入關(guān)后的第一位皇帝，沖齡登基，英年早逝，給后人留下了不少謎團。

監(jiān)處死殉葬，后又在孝莊太后的勸阻之下，才放棄了這一想法。

董鄂妃的梓宮從皇宮移往景山觀德殿時，為她抬梓宮的都是滿洲八旗貴族中的二三品大員，這在清代也是絕無僅有的，就連皇帝的喪禮中也未見過這樣大的陣仗。然后，順治又在觀德殿里為她舉行了一場規(guī)模很大的水陸道場，108名僧人整日誦經(jīng)，21天里經(jīng)聲不斷。

按照清朝慣例，遇到國喪時，皇帝便需要用藍筆代替朱筆批奏章，直到27天后再改用朱筆。然而董鄂妃去世之后，順治竟用藍筆達4個月之久。

順治本來就體弱多病，在痛失愛子與最重要的人生伴侶之后，他也垮了。幾個月后，正值元旦之際，四處都在張燈結(jié)彩，順治卻患上了天花。

朝廷頒布命令要求全國百姓“毋抄豆、毋點燈、毋潑水”(迷信治天花的一種辦法)，并下大赦令。然而沒幾天，順治就病逝了。還有一種傳說，說順治帝失去董鄂妃后心如死灰，不再留戀紅塵，于是選擇出家為僧。