但凡在朱祐簡介中，都和另一個重要人物是分不開的，這個人就是東漢的第一位皇帝，光武帝劉秀。因為朱祐和劉秀、劉演兄弟自幼相識，而且還一起在長安念過書，在新朝農民軍四起的年代，劉秀、劉演兄弟在舂陵起兵，朱祐便成為了劉演的護軍。后劉演被更始帝殺害，朱祐孤身一人去向劉秀報信，并一直在劉秀軍中效力。

更始元年，朱祐和劉秀一起征討河北地區，他們先后擊破盤踞在河北的王朗和數十支農民軍，朱祐戰功顯赫。在掃平河北后，劉秀稱帝，封朱祐為建義大將軍。

同年七月，朱祐和劉植、堅鐔、岑彭等人一起參與圍攻洛陽的戰役。這一場戰役至關重要，對東漢勢力定鼎中原起著決定性的意義，同時鎮守洛陽的是參與殺害劉演的朱鮪。在朱祐等人的拼死力戰之下，朱鮪投降。劉秀便定都在洛陽，朱祐被封為堵陽侯。

第二年，朱祐和王梁、賈復等人與五校農民軍與檀鄉農民軍戰于漳水，斬殺十余萬人。之后又在羛陽之戰中，迫降了五萬五校軍。

建武二年十一月，董訢、鄧奉叛亂，朱祐奉劉秀之命前去平定，結果在和鄧奉的交戰中失敗被俘。但鄧奉沒有殺朱祐，反而被朱祐勸降。

建武三年，漢軍和黎王秦豐交戰。漢軍一路進展順利，卻在秦豐的都城黎丘城下久攻不下。劉秀十分憤怒，讓朱祐在城破之后誅殺秦豐及其三族。朱祐經過兩年時間的圍城，終于迫使秦豐投降，但朱祐沒有殺死秦豐，只將他押往洛陽聽候處理。

建武九年，朱祐奉命討伐依附匈奴的盧芳，但由于盧芳受到了匈奴的支援，因此朱祐被擊退，他和王霸等人退兵常山郡的南行唐一帶，組建防線，阻擋匈奴勢力的南下。

建武十五年，朱祐主動刺去官職，賦閑在家，于十年后去世。

朱祐的故事

朱祐和漢光武帝劉秀是從小一起玩到大的好朋友，因此朱祐的故事，也大多和劉秀有關。

有一次，朱祐和劉秀一起在長安求學，不料劉秀得了重病，需要買蜂蜜入藥。但當時的劉秀身上沒錢，買不起蜂蜜。朱祐得到這個消息后，立即從自己的口袋里掏出錢，為劉秀買了蜂蜜。這件事劉秀一直記在心里，他在洛陽稱帝后，就賞賜給朱祐一石白蜜，并對他說：“這些蜂蜜，和我們一起在長安時買的那些蜂蜜比起來怎么樣？”由此可見，劉秀和朱祐的關系，親密到如同兄弟一般。

還有一次，也是發生在劉秀和朱祐一起求學長安的時候。劉秀去找朱祐，等了朱祐很長時間，終于等到了他。但朱祐所做的第一件事，竟然不是去招待劉秀，而是先去經堂聽課。后來劉秀成為了皇帝，去到朱祐家里。這一次，朱祐不敢怠慢，趕緊出門去迎接劉秀。劉秀看見他，笑著說“這一次，主人該不會又丟下我一個人去聽課了吧？”

劉秀成為皇帝以后，和將領們的關系唯獨和朱祐最好。而朱祐又直言敢諫，敢說別人不敢說的話。在劉秀剛出河北的時候，在行軍的路上，朱祐大罵更始帝，勸劉秀自立。劉秀怕人多而雜，十分生氣，假裝拿起劍要殺朱祐。在劉秀擊破王朗之后，朱祐再次勸他自立，劉秀又假裝生氣，要把朱祐收監。雖然每一次朱祐勸劉秀自立，都會引得劉秀對他訓斥一番，但兩人的關系卻越來越好。從這個朱祐的故事中可以看出，劉秀把朱祐當成自己的兄弟一樣看待。

朱祐的評價

自古以來，一直都將“二十五史”作為中國歷史的官方資料和權威信息，因此對于朱祐的評價，我們也應該先來看看范曄在《后漢書》中怎么說。

范曄首先說，朱祐“質直，尚儒學”。這句話已經透露出兩個信息，說明朱祐生性耿直，而且對儒學有一定的研究。但是朱祐并非一個迂腐的文士，他除了在文化造詣上頗有成就之外，對于帶兵打仗，也很有一套。因此范曄又提到了朱祐帶兵打仗的事情，他除了能打勝仗，最主要的一點，就是他宅心仁厚，所以他“將兵率眾，多受降”。他打的勝仗，斬下的敵人首級很少，大多是逼降敵人。評價朱祐說宅心仁厚，也是有依據的。當劉秀和黎王秦豐交戰時，漢軍已經把黎王圍困在黎丘。劉秀親自去城下招降秦豐，不想被秦豐罵了一通。因此劉秀心里十分不爽，對朱祐說，攻下黎丘之后，一定要殺死秦豐，并誅滅其三族。朱祐在圍城兩年后，終于攻下黎丘。但是他并沒有殺死秦豐，而是把他押往洛陽，讓劉秀發落。有人因此彈劾朱祐，但劉秀覺得朱祐此舉是大仁大義的行為，因此也沒有責怪他。

《后漢書》同時對朱祐的評價說“禁制士卒不得虜掠百姓，軍人樂放縱，多以此怨之”。這一點，同樣和朱祐的儒雅仁厚有關。他禁止士兵搶掠百姓，但士兵們都喜歡放縱，因此經常埋怨他。由此可見，在士兵之中，朱祐的評價并不高。

《國榷》的作者談遷對朱祐評價說，朱佑、劉隆、劉植等人，有的立有汗馬功勞，有的運籌帷幄，但無論如何，他們都可以被稱為名將，是東漢復興戰爭中的中流砥柱。