從1949年1月31日開始，解放軍陸續進城，接管了北平的防務。2月3日，在解放軍舉行盛大入城式的時刻，傅作義獨自坐在北平西郊原華北“剿總”司令部的駐地內。他沒有參加入城式，解放軍沒有邀請他，他也沒有主動報名。此時，他正在為一封剛公布的電函而憤怒。2月1日《人民日報》北平版創刊號上，傅作義看到這樣的標題，“林羅兩將軍曾致函傅作義：任何頑抗必遭覆沒，和平解決可望折罪！”公布的電函中，沒說傅作義一句好話，其功績也一點不提，他還是個罪大惡極的“戰犯”。

看到這份“書面通牒”，傅作義驚呆了！心情之壞，比當初看到“戰犯名單”時還有過之而無不及。看到“戰犯名單”時，他手頭還有軍隊，還有談、打、進、退的余地。而現在，他已什么都沒有了。共產黨什么都拿到了，卻倒過來開始清算他過去的老賬了！傅作義被激怒了。他給林彪寫了一封氣憤異常的長信。在信中要求毛澤東馬上給他指定好監獄，他要去主動投案自首。

傅作義不知道，這封由毛澤東起草的信件，1月16日就已經寫好了。信寫好的當天下午，談判雙方就達成《北平和平解放的初步協定》。告別時，林彪把這封信交給鄧寶珊，讓他轉交傅作義。信未封口，鄧寶珊看罷大驚失色，決定暫時對傅作義保密。后來，羅榮桓、聶榮臻追問信的下文，鄧寶珊只好把信交給傅冬菊，讓她轉交。傅冬菊看后怕父親生氣，也沒轉交。

這封“公函”，讓傅作義氣憤、失落、煩躁。為了安撫傅作義，林彪、聶榮臻特地在北京飯店小宴會廳宴請傅作義。林彪一上來就先給傅作義吃了顆定心丸，說傅作義有功，共產黨不會虧待。“便宴談話”后，傅作義的情緒略有改變，但心中的不滿仍未消除，他甚至向國民黨南京政府外交部發電，要申領護照出國，離開北平。接著發生的情況更讓傅作義心情惡劣。在軍管會安排下，傅作義從西苑搬進了釣魚臺。搬完家沒幾天，電話響了，聽筒里的聲音很沖：“我代表西城區人民政府通知你，立即到人民政府登記。”

“我是傅作義！”傅作義提醒對方。對方十分強硬，“通知的就是你傅作義。北平人民政府通告：凡國民黨軍、警、憲、特人員，必須限期登記！你難道不是國民黨軍官？”傅作義不知如何作答。傅作義失衡的心理，無法調整。這一切，直到他見過毛澤東后才有所改變。2月22日，傅作義和鄧寶珊一起，從北平乘飛機先到石家莊，后轉乘汽車到西柏坡。當晚，毛澤東就到他的住處看望了他。傅作義第一次見到毛澤東，很惶恐，他趕緊說：“毛主席，我有罪！”毛澤東卻說：“不！你有功！抗日戰爭你為人民立了大功，和平解放北平古都，你又為人民立了功，人民是不會忘記你的。”這讓傅作義心情大好。第二天回到北平時，大家都看到傅作義面貌一新，與去石家莊之前判若兩人。4月1日，傅作義向全國發表通電，表示擁護共產黨和毛主席的領導。建國后，傅作義被任命為新中國第一任水利部長。

對新中國建設充滿信心的傅作義，把自己的弟弟傅作恭從美國勸回，讓這個水利專家回國效力。傅作恭回國后被派往甘肅搞水利建設，結果在三年困難時期，被打成右派后餓死在酒泉夾邊溝農場。半年之后，傅作義在去甘肅檢查工作時才得知弟弟的死訊。這成為傅作義一生最追悔莫及而又無法挽回的一大憾事。