袁世凱在朝鮮甲申政變中為維護大清朝利益，所做出的種種貢獻，可以稱得上是實實在在的功不可沒。但是大家不要忘記了，袁世凱的種種舉動都是私自做出的，無論是壓制政變還是與朝鮮國王以禮儀往來，都不是得到自己的上司，也就是代表著清政府的李鴻章所同意的，他第一次任性，假傳的是吳長慶的命令，吳長慶不僅沒有怪他，反而大大提拔了他。可這一次，袁世凱可是背著李鴻章乃至整個清朝政府私自集結兵力幫助朝鮮壓制政變，如果算起老賬來，把他拉出去砍了也說的過去。

果不其然，事件平息后沒有多久，就傳來了李鴻章的命令，對袁世凱私自用兵之事進行了詳盡的審查。但是，在背后捅袁世凱一刀的人并不是李鴻章，再說李也實在沒有這個必要。雖然，收到駐朝使節的來報之時，李鴻章是極力反對去挑釁日本的，但當袁世凱三下五除二把政變平息的消息傳到京城的時候，李鴻章是大為所喜，一個小小的袁世凱，就那么輕而易舉的在國門之外把這件放了誰都頭疼的難事兒給解決了。

李鴻章雖然派出了特使來到朝鮮調查事件的所有經過，但其本意上并沒有要把袁世凱怎么樣的意思，被李派來的特使也對李鴻章的心意熟知于心，只是查查問問，但對袁世凱本人還是極為看中的，甚至于會有意無意流露出對袁世凱的器重。就這樣，這件事兒就這么不了了之了。所以，李鴻章并沒有責難袁世凱，更沒有讓他卸甲歸田，回家種地的意思。李鴻章之所以是李鴻章，絕不是個不分忠奸，殘害忠良之徒。那么，從袁世凱立得大功，到他向朝廷請辭之間，到底發生了什么？到底是什么人？什么事讓他不得不在風頭正盛的時候做出這樣的選擇呢？

特使對袁世凱的調查不了了之，而袁世凱則繼續留在朝鮮為清政府賣命。由于在政變中，不少守舊派大臣都被開化派的人給殺害了，再加上守舊派本身也不太愿意和清政府繼續保持藩國關系，袁世凱為了攏絡人心改變這種局面，就從軍費中拿出來一部分資金，用于安頓在甲申政變中不幸喪命的大臣家屬。他以為這是替朝廷辦事兒，自然應該由朝廷來買單。所以就毫不思索把這筆賬記在了朝廷的名義下邊。

事情就出在了這筆錢上邊。當袁世凱想都不想拿著支出賬單向在合肥的李鴻章匯報的時候，一向對他看好的李鴻章卻不樂意了。他回信告訴袁世凱，國家的銀兩怎么可以就這樣被袁世凱拿著按照自己的臆想去收買人心？而且收買人心也不見得就是一個明智的做法。并勒令袁世凱盡數賠償所支出的銀兩。袁世凱接到消息后，也是不由得心里一驚，立刻派了親信連日返回河南老家，用自己的家財把這部分賬目全數補上，足足六十幾萬兩白銀。

原來，事情蹊蹺在了這里。袁世凱雖然在朝鮮屢建奇功，可他也著實得罪了不少人，其中主要為吳長慶部下的官兵，當然，還包括當時和袁世凱一起處在朝鮮的吳兆有和張光前，袁世凱得罪吳長慶部下自然不必說，想當初，他仗著吳長慶的支持沒少折騰他的這些老同事們。而得罪張吳二人，則是在看不見的地方了。甲申政變袁世凱一人逞了英雄，卻讓張吳二人甚是難堪，尤其是，李鴻章派來的特使對袁世凱私自動兵的行為不聞不問，更讓他們惱火。于是就把袁世凱私自動用軍費的事情給捅了出去。袁世凱只是一個小小的武官，動用軍費等大事情必須要經過張吳等人的同意的。李鴻章得知此事之時，讓袁世凱拿家產賠償，已經是給了他很大的面子了。

袁世凱痛定思痛，覺得周圍的環境似乎有了很多不利因素，又詢問了自己的另外一個叔父袁保齡。不得已向李鴻章提出了辭職歸鄉的決定。