據說，成吉思汗在臨終前曾交代，他死后秘不發喪(為了避免軍心渙散)，并且要遵從祖先留下的喪葬風俗。當時蒙古的喪葬習俗大致如此，蒙古貴族死后，將其埋葬，但不起墳頭，再用許多馬匹將埋葬之地踏平。然后當著母駱駝的面將小駱駝殺死，并淋駱駝血在這片墓地上，還要派上干騎兵來守護此地。等到第二年春暖花開之時，墓地上長出茂盛的草木之后，騎兵才會撤走。這樣一般人看到的只是茫茫的草原或者森林，根本不知道墓地的具體位置。如果親人想要祭奠，就拉著那只母駱駝來引路，如果母駱駝在一片地方駐足并悲鳴，這片地方就被視為先人的墓地。

成吉思汗下葬后，他的墓地變成了一片森林。據說當時守護墓地的1000多名騎兵和造墓者都被殺死了，為的就是不泄露成吉思汗陵墓的位置，以免打擾他安息。后來，在那只母駱駝死后就沒有人知道其墓地的確切位置了，這也就成了一個干古之謎。現在位于內蒙古自治區伊金霍洛旗甘德利草原上的成吉思汗陵，也并非成吉思汗的真正陵寢，而是一座衣冠，其中并無成吉思汗的遺體。不過，經過專家們多年來的探索和研究，對成吉思汗真正的葬身之處，大致有以下五種說法。

第一種說法，成吉思汗葬在了今蒙古國境內的肯特山南麓。依據是有關史料記載，成吉思汗在生前的某一天，曾經靜坐在肯特山上的一棵樹下沉思，后來突然起身站立，對隨從說：“我死后，就將我葬在這里。“另外，在南宋的一些文人的筆記中也有記載：成吉思汗病逝后，他的遺體被運送到了漠北肯特山下的某個地方，然后挖坑深埋，萬馬踏平。

第二種說法，成吉思汗真正的墓地在新疆北部的阿勒泰山上.據《馬可.波羅游記》記載：在把大汗的靈樞運往阿勒泰山的途中，護送的人將沿途遇到的所有人都作為殉葬者。另有史料記載說，成吉思汗在臨終前曾命令屬下將其靈樞運回蒙古安葬。這樣看來，其遺體很有可能就安放在阿勒泰山上.

第三種說法，成吉思汗的遺體被葬在了寧夏境內的六盤山。依據是成吉思汗攻打西夏時死于六盤山附近，按照蒙古族當時的習俗，人在去世三天內就要下葬，以防止尸體腐爛，靈魂上不了天堂。成吉思汗死在了七月，那時正值盛夏為了避免尸體腐爛，成吉思汗就地安葬的可能性還是非常大的。

第四種說法，來源于哈薩克斯坦一位歷史學家奧斯科爾科夫的考證，他認為成吉思汗的安葬地點在哈薩克斯坦的里杰爾(今列寧諾戈爾斯克地區)。他說成吉思汗生前曾指定要將自己安葬在阿爾泰山脈的一處人跡罕至的地方，經他考證發現，里杰爾就是成吉思汗所指之處。奧斯科爾科夫說：考古學家在那里發現了石器時代的人類遺跡，卻沒有發現青銅器時代，以及鐵器時代的人類遺跡，為什么這片地方這么特殊呢？很大的可能便是這里是人為劃定的禁區，所以這里極有可能是成吉思汗墓地的禁區。

第五種說法，源自內蒙古杜科院的研究員潘照東之口，他認為位于鄂爾多斯高原的阿爾塞石窟附近極有可能就是成吉思汗的真正墓葬之地。這里的地貌、地名等特征與《蒙古秘史》、《史集》等史料中關于成吉思汗墓葬之地的描述極為相似，并且在阿爾塞山的一個石窟中還有一幅與成吉思汗的安葬關系密切的壁畫，潘照東推斷，這幅壁畫應是《成吉思汗安葬圖》。另外，此處曾經是成吉思汗當年攻打西夏時的大后方，距離六盤山不太遠，要是將他的遺體從六盤山運至此處，三天時間是足夠用的。綜合種種因素來看，潘照東的分析也不無道理。

分析至此，也許有人會問，既然有這么多疑似成吉思汗墓的地方，為什么不把成吉思汗陵建在其中一地呢？至于選擇伊金霍洛旗的甘德利草原來建造成吉思汗陵，也是有講究的。成吉思汗的第34代嫡孫、中國的最后一位蒙古王爺奇忠義先生為我們揭曉了這個問題的答案，這是一個流傳在鄂爾多斯草原上的美麗傳說。

相傳1226年，成吉思汗率軍西征西夏時，路過了這個地方。他見這里水草豐美、花鹿出沒，忍不住沉浸在這片迷人的景色中。而后，他對左右隨從說：這里簡直是人間仙境，將來我死后就要葬在此地。“誰知第二年，他便真的病死在了六盤山的軍中。屬下在將其靈樞運往蒙古故鄉的時候又路過了此地，恰巧靈車的車輪陷在了地里，人推馬拉都無法將靈車拉動。這時，有人突然想起了成吉思汗途經此地時說的那句話，便將其安葬在了這片美麗的草原上。

對于一代帝王成吉思汗本墓葬之謎，考古學家可謂是費盡心思，傾其全力，但是卻未能給我們一個準確的說法。我們不妨設想，也許成吉思汗本意正是如此吧，因為他并不想被后人打擾。